Friday, December 8, 2017

Yet Even More DifferInt

More DifferInt model results.

Note that genepool is exactly the same between both populations, but rearranging genotype combinations gives some differentiation at single and multiple locus measurements even when including elementary genic differences, and there is complete differentiation at the level of multiple locus genotypes neglecting elementary genic differences, even though the genepools are identical and there is not a very large number of genotype rearrangements between the populations. This shows how rapidly complete differentiation is achieved when considering discrete genotype combinations.

(A = 1, T = 2, C = 3, G = 4, first number = number of individuals per genotype)

 #Population1
1  1 1  2 2  2 3  3 3  1 1  1 4 1 1  2 2  3 3  3 3  1 1  4 4
1  1 1  2 2  2 3  3 3  1 1  1 4 1 1  2 2  3 3  3 3  1 1  4 4
1  1 1  2 2  2 3  3 3  1 1  1 4 1 1  2 2  3 3  3 3  1 1  1 4
1  1 1  3 2  2 3  3 3  1 1  1 4 1 1  2 2  2 3  3 3  1 1  1 4
1  1 1  3 2  2 3  3 3  1 1  1 4 1 1  2 2  2 3  3 3  1 1  1 4
1  1 2  2 2  2 3  3 3  1 1  1 4 1 1  2 2  2 3  3 3  1 1  1 4
1  1 2  2 2  2 3  3 3  1 1  1 4 1 1  2 2  2 3  3 3  1 1  1 4
1  1 2  2 2  2 3  3 3  1 1  1 4 1 1  2 2  2 3  3 3  1 1  1 4
1  1 2  2 2  2 3  3 3  1 1  1 4 1 1  2 2  2 3  3 3  1 1  1 4
1  1 2  2 2  2 3  3 3  1 1  1 4 1 1  2 2  2 3  3 3  1 1  1 4

#Population2
1  1 2  2 2  2 3  3 3  1 1  1 4 1 1  2 2  3 3  3 3  1 1  1 4
1  1 2  2 2  2 3  3 3  1 1  1 4 1 1  2 2  3 3  3 3  1 1  1 4
1  1 2  2 2  2 3  3 3  1 1  1 4 1 1  2 2  3 3  3 3  1 1  1 4
1  1 1  2 2  2 3  3 3  1 1  1 4 1 1  2 2  2 3  3 3  1 1  1 4
1  1 1  2 2  2 3  3 3  1 1  1 4 1 1  2 2  2 3  3 3  1 1  1 4
1  1 2  3 2  2 3  3 3  1 1  1 4 1 1  2 2  2 3  3 3  1 1  1 4
1  1 2  3 2  2 3  3 3  1 1  1 4 1 1  2 2  2 3  3 3  1 1  1 4
1  1 1  2 2  2 3  3 3  1 1  1 4 1 1  2 2  2 3  3 3  1 1  1 4
1  1 1 2 2  2 3  3 3  1 1  1 4 1 1  2 2  2 3  3 3  1 1  4 4
1  1 1  2 2  2 3  3 3  1 1  1 4 1 1  2 2  2 3  3 3  1 1  4 4

Genepool: 0.0000
Single locus including elementary genic differences: 0.0167
Single locus neglecting elementary genic differences: 0.0333
Multiple locus including elementary genic differences: 0.0410
Multiple locus neglecting genic differences: 1.0000